如来也特别照顾孙悟空，把孙悟空的道场安排在花果山，他可以不朝见，也不需要来灵山参佛，自由自在，一般不受约束。有沙僧的忠厚老实，遇事只知道“大师兄怎么办”之外，好多劫难都是孙悟空将他们解救，并没有一走了之，当然了有人会说他有金箍呢，我觉得这一点算不得原因，因为就从三打白骨精来看，唐僧并不相信孙悟空，多次赶其走，孙悟空都不离弃。
如来为什么不杀死孙悟空？
孙悟空这个小猴子自从菩提祖师处学得本领，重回花果山后到处招惹是非：首先闯龙宫、抢如意金箍棒；闹地府、销毁生死薄，破坏天庭秩序；偷蟠桃、盗御酒，挑战玉帝权威；最后和天庭十万天兵天将对战，与天庭在编人员打的不可开交。数罪并罚，砍猴哥十个脑袋都没有问题，但如来为什么没有帮玉帝杀他呢？佛教不杀生，不可杀如来明白玉帝的意思，但是道佛两教的理念完全不同，佛家历来讲究慈悲为怀、四大皆空，佛教三皈五戒第一戒就是戒杀生，他们秉持“放下屠刀，立地成佛的”理念普渡众生，佛祖处理的方法以收服教育为主，对于猴哥这种十恶不赦的妖怪，在佛祖的眼里，还是可以调教的，稍微打磨便可成可用之大器，大鹏鸟就是一个很好的例子。
如来忌讳孙悟空背后的势力，不敢杀太上老君太上老君和孙悟空的关系非常紧密，甚至可以说孙悟空的生命就是太上老君造就的。取经路上凡是有持有太上老君法宝的妖精孙悟空都打不过，可见二者实力差距巨大。孙悟空大闹天宫时太上老君也只是收服了他，还帮他练就火眼金睛，任他胡闹就是不杀他就是明证。孙悟空前世为女娲补天所遗之仙石，道家精心孕育的仙宝。
如来在降服孙悟空的时候，也讲过一句话：“趁早皈依，切莫胡说！但恐遭了毒手，性命顷刻而休，可惜了你的本来面目！”这句话交代的很清楚，如来是明白孙悟空的本来面目的。为何知道，因为如来有慧眼，他知道孙悟空过去的一切。太上老君位列三清，没有太上老君的允许，如来自然是不敢乱动，最后的办法就是把孙悟空压在五行山下让其自行悔过。
菩提老祖菩提老祖是孙悟空恩师。菩提老祖所居住的地方，灵台方寸山，可是西天如来佛祖的管辖之内，如来佛祖住在天竺灵山。西游记中带祖称呼的不多，个个都是顶级大佬，完虐孙悟空没商量，两人从住处到称呼再到法力都差不多，又同在西牛贺洲，可见相互是比较熟悉的，应该是同一级别的大神，但信仰不同，派别不同，一直没冲突，到也相安无事。
孙悟空是菩提老祖最得意的弟子，一身本领深得其真传。如来佛祖不看僧面看佛面，肯定也要给菩提老祖面子。忌惮孙悟空真正的来历如来佛祖被玉帝请来后并没有立即向孙悟空下手，而是首先给了他一次警告，让他自己回头是岸，并且淳淳告诫他修行不易，千万不要鲁莽行事，否则稍有不慎就会遭到他人毒手，顷刻间丢了性命。从语气来看，这就好比一个长辈对晚辈在说话，而且带有告诫的意思，语言间颇为宽松。
最后在孙悟空依然执迷不悟的情况下无奈把其镇压在五指山下。其原因只有一个，那就是孙悟空他不敢杀，从孙悟空的身世来讲，他是女娲补天的石头，说白了就是上古天神留下的。虽然《西游记》中没有交代女娲、盘古在哪里，但是对于这种创造世界级别的天神，不管是谁都会给面子的。孙悟空的两种法术西天取经路上无可替代，不能杀孙悟空的法力虽没有达到登峰造极的地步，但他有两种强大的法术，更关键的是，这两种法术三界之中恐怕只有孙悟空同时兼备，无可替代，西天取经路上必须用。
唐僧西天取经，不可避免地要穿越荒无人烟的荒山、大漠、森林，唐僧是凡人，必须吃饭，对常人来说化缘就成了大问题，因为离人类居住区太远，但这对孙悟空来说，不是难事，因为孙悟空有筋斗云，一个筋斗十万八千里，不论唐僧身处何地，孙悟空都可以及时帮他化缘，保证唐僧不会挨饿，更不会饿死。取经之路崎岖险恶，妖魔横行，如何识别妖魔的各种阴谋诡计、确保唐僧安全是重中之重。
妖魔都擅长变幻，不好识别，但这对孙悟空来说，也不是难事。因为孙悟空有火眼金睛，不论妖怪变幻成何等模样，也逃不过他犀利的眼神。他可以及时发现妖怪，消除隐患，避免因延误时机。如来扩充实力所需，不宜杀当时的佛教，并不盛行，佛教急需扩充自己的实力，如来佛祖看到孙悟空的实力强大，潜能无限，便心生爱才之意，想要将之拉到自己的阵营。
