不过所谓的隐藏路线，仅仅是选择路线之后遇到的敌兵稍微有所不同而已。而在《合金弹头2》中出现了真正意义上的隐藏路线，初期甚至玩家们都没有发现。后期终于有玩家发现了，但是都不知道神灯的使用方法，直接吃掉加了十分《合金弹头3》中的支线是最多的，很多玩家甚至到现在都还没有搞明白到底有多少条隐藏路线。一般的路线都是在明眼处，虽然比较复杂但是并非是玩家不可到达的。
不过鸵鸟关和大象关就相对比较难找一点，当年我们最初玩的时候几乎都错过了。都是多年之后的某一天才发现了原来还有这么一条路线，感觉当年白玩了。不过，玩家要是选这两个隐藏路线的话，难度会降低很多的。隐藏路线和其他路线都是一样的，玩过之后就可以直接面对BOSS。不需要再将常规路线走一次。鸵鸟关大象关《合金弹头4》中的隐藏关倒是不多，一关隐藏关可以看到那些穿白大褂的科学家正在研究基因改造，将人类直接变成猴子。
玩家在这个场景中要是被科学家的子弹击中，就会直接变成猴子。不过在后面可以找到血清。《合金弹头5》中只有两条隐藏路线，都是非常神秘的，估计当年玩家都错过了。第一个隐藏路线在第一关，这里需要走位才能到达隐藏位置。里面有一个最新研究出来的小BOSS坦克，正在大量屠杀土著人。玩家到达之后会发现大量的土著人尸体，而小BOSS的攻击方式则让玩家措手不及。
另外一个隐藏点在通风口，当年又有多少玩家会认为这里可以通行？玩家只要跳到小兵的位置就可以触发隐藏路线。而隐藏路线的难度并不是很大，只需要在升降机上面保持站位就可以了。《合金弹头6》中的隐藏路线就只有那么一条，而且是关系着结局到底是谁来救主角。隐藏路线中，玩家可以乘坐火星之根进行战斗。直接杀入金星人的老巢。
街机游戏《合金弹头》系列中出现过哪些比较怪异的生物？
《合金弹头》到目前为止已经推出了1-7部正统续作，其中还包含了X和XX。而在这期间出现的BOSS，玩家几乎都是了如指掌。整个系列中出现的生物BOSS也是比较多的。《合金弹头1》中的摩登和艾伦、《合金弹头3》中的寄居蟹、莫罗之眼、火星之根、《合金弹头5》中出现的死神、《合金弹头6》中的海蛇、异形皇后，而到了《合金弹头7》中涉及到了未来题材，出现的都是未来科技，并没有生物出现。
那么在合金弹头系列包括外传中，到底出现了哪些玩家并不是很熟悉的生物呢？Zoni Doloma这只鱼居然存在于沙漠之中，沙漠那一代的的人都知道这只可怕的怪物。不难看出，这只怪物是被外星人改造过的生物，拥有超高的智商。有意思的是，它知道人类喜欢什么，故意将宝箱放在明眼处，吸引的游客过去，然后将人直接吞了下去，在这只怪物眼里人类最美味的猎物。
人类善于用诱饵钓鱼，但是没想到的是这只怪物懂得用黄金宝箱来钓人。Great Mother游戏中比较少见的虫类母体玩家们面对的生物几乎都是产自于它，她那扇动翅膀的声音，使宇宙中所有的生物都能感到恐惧。它的体内有大量自爆小虫子，在它生命受到威胁的时候就会释放攻击Cyclobster一种巨大的变异水母，巨大的身躯配上两只尖锐的触手，拥有强大的战斗力Brain Robot脑机器人是由外星大脑控制的大型机器人。
大脑被安置在一个坚硬的玻璃头盔中。两个眼球通过神经与大脑相连。这个大脑是什么生物不得而知，不过被外星人连同眼球和大脑一起剥了下来并保持连在一起，最终制成了这个机器人。这个桥段和电影《天际浩劫》比较相似，电影中就是外星人入侵，将人类全部吸收到外星仓，然后取出人类大脑放入外星机器人头部，这样机器人就有了生命，而且完全听从指挥。
主角最终也难逃被捕捉的命运，但是他的大脑被取出来之后竟然颜色与众不同，在被植入到外星机器人之后保留了最初的记忆，于是自己控制了这个机器人保护爱人。Dark Monoeye莫罗之眼是一个15米高的外星人，也是摩罗十诫神秘的守护者。他的头部就是一只眼睛，看上去和人类一样拥有四肢。主要攻击方式就是眼睛中喷射出来的能量球。
另外，他们是丧尸病毒的病原体。除了《合金弹头3》，在之后的版本中也出现过，而且是变种体，在这种情况下感染的丧尸威力高于常态。Flying Parasite寄生虫在游戏中出现了很多次，初期也就寄生一些小杂兵。后期再一次机缘巧合之下竟然控制了正规军成员。寄生虫能够将被控制的生物能力最大化，因此玩家面对被寄生的正规军时有一场恶战食人花母体在合金弹头3中出现了大量会移动的食人花，这些生物攻击力非常恐怖，可以直接吞食人类。
