曾国荃长围久困，攻克吉安后不久，湘军在三河镇大败。其后，太平军又破江北、江南大营，东征苏南，形势复振。可是，太平军的复振，又因曾国荃围困安庆而嘎然而止。曾国荃在安庆城北、城南挖掘壕沟两道，内壕围困安庆守军，外壕抗拒援军，再次采取长围久困之法。陈玉成调集大军来解围，曾国荃先是依托壕沟与之大战，待陈玉成力竭转移之时发起反击，连破太平军营垒18座。
陈玉成所部精锐，包括一些捻军精锐，悉数折损于此战。其后，曾国荃又连败陈玉成、杨辅清、洪仁玕等援军，并于9月攻陷安庆。曾国荃攻陷安庆，使太平天国由“中兴之像”秒变“濒临灭亡”。随后，曾国荃又挥师西进，进攻天京。曾国荃孤军深入，居然只以水陆不满2万人进逼天京城下，逐步展开对天京的围困。李秀成率十三王，30万大军（号称60万）而来，与曾国荃在雨花台大战46日。
但是，曾国荃居然扛住了李秀成，站稳了脚跟！其后，曾国荃逐步攻占外围阵地，收紧包围圈，使天京内外断绝。在围攻近三年后，曾国荃攻破天京，太平天国灭亡！可以说，镇压太平天国最为关键的安庆之战、天京之战，都是曾国荃主打的。围吉安，使石达开无法在江西立足，被迫远征，威胁大减。围安庆，使刚刚展现中兴之像的太平天国迅速变得危亡。
围天京，最终灭掉了太平天国。曾国荃，由此跻身清中兴将帅之列。军事才能评价：一招鲜，吃遍天曾国荃连番立功，其实套路都是一样的：“结硬寨，打呆仗” “挥金如土，杀人如麻”。这个套路，打太平军是真好使。太平军自军兴以来，横扫东南，所依仗的是其运动战能力。至于攻坚固城池、工事，则一直办法不多。当年，太平军从广西一路打到南京。
但他们对一度只有数千守军的桂林、长沙却久围不克。所以，即使在攻克南京，几十万大军气势正旺之时，杨秀清也不愿先攻打就在天京城门口的江南大营，而要千里迢迢北伐、西征，继续打运动战。所以，曾国荃只要把硬寨扎稳，太平军办法不多。另一方面，自1855年以后，曾经辉煌的太平军水师已经被摧毁，湘军已经掌握了制水权。
而曾国荃与太平军争战，皆是沿江作战（围吉安时为吉水，围安庆、天京时为长江）。因此，表面上看起来曾国荃深陷敌围，但因水路在手，后路不断，补给不绝，有长期坚持的条件。相反，由于曾国荃围困的是太平军最主要的政治、经济中心，因此，外围太平军来援时，反而缺乏足够的补给。结果，面对“挥金如土，杀人如麻”的曾国荃，反而是“主场作战”的太平军先坚持不下去。
历来，官军与起义军作战，最怕的就是起义军机动灵活，官军被牵着鼻子走。曾国荃“结硬寨，打死仗”，使太平军被迫放弃其最擅长的运动战，只能与曾国荃进行其不擅长的攻坚战，变成拼消耗。而水师之利，以及湘人独特的霸蛮之气，又使曾国荃的“硬寨”有了物质和精神的双重保障。曾国荃“结硬寨，打呆仗”，陈玉成、李秀成又是“围魏救赵”，又是“进北攻南”，玩得跟花一样，却还是一筹莫展。
“一招鲜，吃遍天”。只会这一招镇压太平天国期间，曾国荃经常上演以1、2万孤军击退对方名将所统帅的数十万大军。如果只看镇压太平天国的表现，曾国荃简直可以与任何军事家相媲美。然而，从曾国荃此后的军事表现看···曾国荃，真的只会这一招！1866年，曾国荃担任湖北巡抚，镇压捻军。他到任后，大刀阔斧，裁汰冗兵，增湘军6000。
他“以贼多骑，难以追逐，欲困之山地”，还是要搬出长围久困这一招来。可是，当年曾国荃这招奏效，是因为“围敌必救”，任太平军千变万化，始终还是要跑来解围，跳不出曾国荃的计划圈。如今，捻军没有那么多“必救”，不吃这一套。他们机动灵活，照样牵着湘军的鼻子走。结果，曾国荃的猛将郭松林大败，爱将彭毓橘战死，一败涂地。
曾国荃摘顶，被撸了。此次被撸后，曾国荃表示：从此不再带兵。看来，曾国荃算有自知之明：他就会一招，那招不灵，自己就不行了。此后，曾国荃在海防事务上，也继承了“结硬寨”。担任两江总督兼南洋大臣时，他对海防提出了许多看法。他海防的基本思路是：“水面、水岸兼防，互为犄角”。任职期间，“这一时期南洋海防经费主要用于沿海的炮台建设”。
曾国荃在各地修建炮台，购置大炮。有学者、朋友认为曾国荃这一思维是在经费有限的情况下务实之举。其实，单纯依赖“塔防”来搞海防，无异于守株待兔。拱手让出主动权，大沽口也好，旅顺港也好，修建得再好，也根本不堪一击！何况···曾国荃花费巨资修筑的炮台体系并不好。当年打太平军修硬寨时，曾国荃可以严格把控，质量过关。
